第1章：謎の事件
東京のあるビルの一室で、ジュンイチ・タカハシはマリ・スズキと共にカズヤ・ワタナベとユウジ・オカモトの死亡事件を調査していた。近未来の東京の空気が、事件の謎をさらに深めていた。
ジュンイチ：「カズヤの最新の発明品が盗まれたって、どんなものなんだろう？」
マリ：「分からないけど、カズヤ博士はいつも画期的な発明品を生み出していたわ。それが原因で誰かに狙われたのかもしれない。」
ジュンイチはカズヤの研究室に残された資料を読みながら、事件の手がかりを探していた。
ジュンイチ：「この資料によれば、カズヤはエネルギーの効率的な利用に関する研究を行っていたらしい。それが最新の発明品と関係してるのかな？」
マリ：「それは大発見ね！ もし成功すれば、世界中のエネルギー問題が解決するかも。」
ジュンイチ：「そうだね。だが、それが彼の命を奪う結果になるなんて…。」
事件の犯人探しに焦りを感じるジュンイチ。そんな彼に、マリが1枚の写真を見せた。
マリ：「これはカズヤ博士が最後に会っていた人物の写真よ。」
ジュンイチ：「カイト・イシダ…彼は何者だ？」
マリ：「彼は著名な科学者で、カズヤ博士と何度か共同研究をしていたみたい。」
ジュンイチ：「彼が犯人かもしれない。彼についてもっと調べてみよう。」